Coproculture : Bactéries - Levures - Antibiogramme

1. Définition

Examen bactériologique des selles.
Recherche de germes spécifiquement pathogènes : Campylobacter, Yersinia, Staphylococcus aureus, Pseudomonas ... 
Recherche de levures pathogènes : candidose notamment.

2. Indications

Analyse bactériologique rarement demandée chez le cheval, car les affections qu'elle permet de diagnostiquer sont assez rares.
Une coproculture peut être demandée pour déterminer le germe responsable d'une diarrhée résistante aux traitements habituels. 
Une suspicion clinique sur la nature du ou des germe(s) en cause est nécessaire car le milieu de culture utilisé par le laboratoire est différent selon le germe recherché. 
Remarque : penser à la salmonellose lors d'avortements récurrents dans un élevage.

3. Conditions de prélevement

Prélever des selles directement dans le rectum et placer un prélèvement de la grosseur d'une prune dans un récipient propre.N.B. : certains germes (salmonelles notamment) étant présents en très petites quantités, la réalisation de 5 ou 6 prélèvements à 12h d'intervalle est souvent nécessaire pour mettre en évidence ces bactéries.

4. Techniques utilisées

 Ensemencement de milieux sélectionnant les germes recherchés.

• Chapman : staphylocoques
• Sélénite : salmonelles repiqué le lendemain sur Hektoen
• Milieu spécifique pour Campylobacter
• Milieu spécifique pour  Yersinia
• Milieu Hektoen pour Gram -
• Milieu CPS pour contrôler l'équilibre de la flore
• Milieu Sabouraud pour les levures

Un antibiogramme est éventuellement  effectué pour tester un germe potentiellement pathogène.

L'antibiogramme est réalisé sur les souches isolées, selon la norme NFU47-107.

5. Résultat d'un examen normal

La présence d'une flore digestive est évidemment normale. La présence d'Escherichia coli ou de Rhodoccocus equi peut être pathologique ou physiologique selon les cas (une PCR est nécessaire pour déterminer l'entérotoxicité d'Escherichia coli enteropathogène).

6. Interprétation

La coproculture peut être intéressante principalement pour confirmer une suspicion d'infection à Salmonella  sp., Campylobacter sp. (pathogénicité discutable), Clostridium sp. 
On observe parfois la présence de culture pure de Staphylococcus aureus ou de Pseudomona aeruginosa qui peuvent alors expliquer alors les signes cliniques.Un antibiogramme est indispensable en cas de présence de germe pathogène.